말씀하신 오류들은 모두가 Warning 들로서, 특별히 Fix가 되지 않더라도 문제가 없이 사용하실 수는 있습니다.
(단지 관리자 페이지 로딩 시간이 좀 오래 걸리긴 합니다.)
Timeout 오류의 경우 사용중이신 서버와 wordpress.org 사이의 통신시 한 쪽(주로 wordpress.org)에서 응답이 없을 경우 발생하는데, 서버의 오류인 경우 보다는 wordpress.org 의 반응이 느려서인 경우가 대부분입니다.
업데이트시 100% 발생하는 상황이 아니라 자주 발생하기는 하지만 전부는 아니라면, wordpress.org 사이트의 반응이 느려서일 것입니다. 플러그인 업데이트 파일(zip)을 wordpress.org에서 받아와야 하는데 시간이 오래 걸리면 저런 오류가 발생합니다.
전체업데이트 말고 플러그인을 하나씩 업데이트 시도해 보세요.
