워드프레스설치/wp-admin/includes/plugin.php 에있는 함수들을 참고해 보세요.
activate_plugins, activate_plugin, deactivate_plugins, deactivate_plugin 등의 함수를 사용하면 됩니다.
시도해 보시면 아시겠지만, 간단하게 해결되지는 않을겁니다.
워드프레스설치/wp-admin/plugins.php 에서 플러그인을 활성화/비활성화 하는 부분을 참고해 보셔서 제대로된 플러그인인지 확인하는 부분이라던지, 사용자의 권한을 확인하는 부분, 활성화/비활성화/최근활성화된 플러그인들의 설정값을 저장하는 부분 등등을 잘 적용해 보세요.